Еще более тонким методом изучения строения клетки является рентгеноструктурный анализ, основанный на дифракции ("огибании препятствий") рентгеновских лучей. По этому методу на исследуемый образец направляют пучок рентгеновских лучей и на фотопленке, помещенной за объектом, регистрируют полученную дифракционную картину. Этот метод дает возможность не только определять пространственное расположение молекул, но и точно измерять расстояние между ними и даже выявлять их внутримолекулярную организацию.

Метод рентгеносруктурного анализа основан на явлении дифракции рентгеновских лучей. Он применяется для изучения строения молекул белков, нуклеиновых кислот и других веществ, входящих в состав цитоплазмы и ядра клеток. Метод дает возможность определить пространственное расположение молекул, точно измерить расстояние между ними и изучить внутримолекулярную структуру.